高等教育研究所成立于2001年10月，由原广州大学高等教育研究室、原广州师范学院师范教育研究所，原广州教育学院教育科学研究所部分科研人员合并组建而成。现为广州大学校属二级科研机构，集学术研究和研究生教育职能于一体。目前有研究人员10人，特聘兼职研究人员20多人。

高等教育研究所经过二十年发展，在学术研究、人才培养、社会服务及学校服务等方面都取得了丰硕成果。在高等教育原理、高等教育政策与治理、院校研究、高等教育发展理论、两岸高等教育比较、粤港澳大湾区高等教育等领域具有显著的研究优势，连续三次荣获中国高等教育学会颁发的"全国优秀高等教育研究机构"称号。

2019年11月广东省高等教育学会高等教育学专业委员会换届大会上，我所刘晖教授当选第三届理事长，马凤岐教授当选副理事长，汤晓蒙教授当选秘书长。高等教育研究所作为专委会第三届理事会办公依托机构，正在积极融入区域和国家高等教育研究大背景，逐步发展成为独具特色的高等教育研究机构。